KobiERP Yazılımında Muhasebe entegrasyonu için, ilk olarak standart hesap planı oluşturulması gerekir. Oluşan hesap planının kodlarına göre tali hesaplar oluşturulur. Örnek uygulamamızda banka hesap kartı ve cari kartının tali hesap planı oluşturulup entegrasyonu sağlanmıştır. İlgili cari ve banka için alınan havale işlemi gerçekleştirilip muhasebeleştir butonuna tıklandığında muhasebe entegrasyon işlemi gerçekleştirilir. Kontrolü ise Muhasebe Fişleri alanından sağlanır. Eğer yapılan işlemlerde eksiklik var ise muhasebe işlemini gerçekleştirmeden yazılım bizi Muhasebe Entegrasyonu ekranına yönlendirir. Bu ekranda alanlara göre renklendirme ve uyarılar sayesinde eksiklik bulunur ve düzeltilir. İstenilirse toplu muhasebe entegrasyonu işlemi bu ekrandan yapılır.